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分子モデリングソフトAvogadroでの分子の書き方

分子モデリングソフトAvogadroで分子の書きたいがよくわからない。 って方多いのではないでしょうか?私だけでしょうか?w 私は最初よくわかりませんでした。 メタンとエタンしか書けないじゃないか! とか思っていました。 私のように悩んでいる人もいるか…

分子モデリングソフトAvogadroのインストール方法

このページでは分子モデリングソフトであるAvogadroのインストール方法について説明させていただきます。 分子を書くだけでなくGaussianインプットファイルの作成も行うことができます。 また、このソフトはGaussianアウトプットファイルの読み込みも行うこ…

gaussian HOMO,LUMOの可視化方法

Gaussianで計算した分子のHOMO(最高被占軌道)とLUMO(最低空軌道)を可視化する方法について、このページでは説明しています。 ここでは例として水分子のHOMOとLUMOの可視化を行っていきます。 まずは、分子お絵かきソフト(chem 3Dやwinmostarなど)で水分子(H2…

gaussianインプットファイルの作り方 構造最適化編

このページでは構造最適化するためのgaussianインプットファイルの作り方をご紹介いたします。 構造最適化は、インプットファイルに入力された構造を始点として、エネルギーが低くなる方向へ少しずつ構造を変化させ、エネルギーが極小値となる構造を探します…

gaussianインプットファイルの作り方 winmostar編

このページではwinmostarでのgaussianインプットファイルの作り方をご説明しております。 winmostarは無料版と有料版がありますが、今回行うgaussianインプットファイルの作成は無料版でもできます。 まずはWinmostarを起動させましょう。 ライセンスコード…